Pokémon Odyssey เป็นเกมแนวสำรวจดันเจี้ยนที่เน้นเนื้อเรื่อง ผู้เล่นจะได้ผจญภัยในเขาวงกต Yggdrasil โดยเน้นการต่อสู้แบบคู่เชิงกลยุทธ์ การเก็บทรัพยากร และการหลบเลี่ยงศัตรู (FOE) แทนการพิชิตยิมแบบดั้งเดิม มีระบบปรับแต่งโปเกมอนยุค 1-3 อย่างละเอียด เช่น การจัดการค่า EV ด้วยไอเทม และการเปลี่ยน Nature/Ability พร้อมการปรับสมดุลใหม่เพื่อประสบการณ์ที่ไม่ต้องฟาร์มหนัก
เกมนี้เป็นการนำเสนอประสบการณ์ใหม่ที่ดัดแปลงจากเกมคลาสสิก โดยเปลี่ยนรูปแบบการเล่นหลักไปสู่การสำรวจดันเจี้ยนที่เน้นเนื้อเรื่องเป็นสำคัญ ผู้เล่นจะได้ดำดิ่งสู่เขาวงกต Yggdrasil ซึ่งเป็นแกนหลักของการผจญภัยทั้งหมด การดำเนินเกมจะเน้นไปที่การต่อสู้แบบคู่เชิงกลยุทธ์ การบริหารจัดการทรัพยากรที่จำกัด และการหลบหลีกภัยคุกคามที่เรียกว่า FOE แทนที่การเดินทางตามเส้นทางยิมแบบดั้งเดิม
แกนหลักของการเล่นคือการสำรวจและการต่อสู้ ผู้เล่นจะต้องวางแผนการเคลื่อนที่และการใช้ความสามารถของทีมอย่างรอบคอบในการเผชิญหน้ากับศัตรูในรูปแบบการต่อสู้แบบสองต่อสอง (Double Battles) ซึ่งต้องการความเข้าใจในกลไกการทำงานร่วมกันของโปเกมอนแต่ละตัว
เกมนี้มีการปรับปรุงระบบการพัฒนาตัวละครอย่างมาก โดยผู้เล่นสามารถเข้าถึงค่าพลังพื้นฐาน (IVs) ที่สมบูรณ์แบบได้โดยตรง นอกจากนี้ การจัดการค่าประสบการณ์ (EVs) ยังทำได้ผ่านไอเท็มเฉพาะทาง ทำให้การปรับแต่งค่าสถานะมีความตรงไปตรงมามากขึ้น จุดเด่นคือความสามารถในการเปลี่ยนแปลง Nature และ Ability ของโปเกมอนยุคที่ 1 ถึง 3 ได้ ทำให้เกิดทางเลือกในการสร้างทีมที่หลากหลาย
ฉากหลังของเกมคือการสำรวจเขาวงกตขนาดใหญ่ที่เต็มไปด้วยความท้าทายและปริศนา การนำเสนอเน้นไปที่การเอาชีวิตรอดและการค้นพบความลับภายในโครงสร้างที่ซับซ้อนนี้
นอกเหนือจากการปรับปรุงระบบพื้นฐานแล้ว เกมยังมีการเพิ่มเนื้อหาใหม่เข้ามา โดยมีการแนะนำโปเกมอนสายพันธุ์พิเศษที่เรียกว่า Etrian Variants ซึ่งเป็นการนำเสนอความแปลกใหม่ให้กับคอลเลกชันโปเกมอนที่มีอยู่เดิม การออกแบบโดยรวมมุ่งเน้นไปที่ประสบการณ์ที่สมดุล ไม่ต้องใช้เวลาในการฟาร์ม (grind-free) มากนัก
ความแตกต่างที่สำคัญที่สุดคือการเปลี่ยนจากการผจญภัยตามเส้นทางที่กำหนดไว้ล่วงหน้า ไปสู่การสำรวจดันเจี้ยนแบบไม่เป็นเชิงเส้น (Non-linear Dungeon Crawling) ที่เน้นการวางแผนเชิงกลยุทธ์ในการต่อสู้แบบคู่ และการจัดการทรัพยากรอย่างเข้มงวด
เนื่องจากเกมนี้เป็นการดัดแปลงที่เปิดตัวในปี 2025 การอัปเดตล่าสุดมักจะมุ่งเน้นไปที่การปรับสมดุลของ Etrian Variants และการแก้ไขปัญหาที่เกี่ยวข้องกับกลไกการสำรวจในเขาวงกต เพื่อให้มั่นใจว่าประสบการณ์การเล่นยังคงราบรื่นและท้าทายตามที่ตั้งใจไว้