MinecraftEdu, udgivet i 2011, er en version af spillet designet til læring. Her udforsker og omformer spillere en verden bygget af blokke, hvor fokus er på samarbejdsbyggeri og problemløsning. Lærere kan tilpasse spillets indstillinger for at facilitere undervisning på tværs af forskellige fagområder i dette virtuelle miljø.