Paradox'un son geliştirici günlüğünde detaylandırılan bu sistem, Hristiyanlık içindeki birliği ve çatışmaları çok daha derin bir seviyeye taşıyor. Sistemin merkezinde yer alan yedi bölüm, \"Fragile Unity\"den başlayıp \"Crusade Phase\" gibi tarihi dönüm noktalarına kadar uzanıyor. Bu aşamaların her biri, hükümdarlar ve kilise üzerinde döneme özgü, oyunun gidişatını doğrudan etkileyen benzersiz etkiler bırakacak.
Aşamalar arasındaki geçişler ise \"Katalizörler\" (Catalysts) adı verilen bir sisteme bağlanmış durumda. Bu, oyuncuların sadece beklemek yerine kilisenin geleceğine yön verebileceği anlamına geliyor. Din değiştirme, kutsal savaşlar, büyük inşaat projeleri veya hükümdar olarak aldığınız kritik kararlar, kilisenin bir sonraki aşamaya ne zaman ve nasıl geçeceğini belirleyecek. Bir heretik olarak kiliseyi kaosa mı sürükleyeceksiniz, yoksa dindar bir kral olarak birliği mi koruyacaksınız? Seçim tamamen sizin stratejinize kalmış.
Katolik dünyasının başındaki figürler için de yeni oyuncaklar yolda. Papa artık \"Papal Bulls\" (Papalık Kararnameleri) aracılığıyla Haçlı seferi çağrısı yapabilecek, belirli inançları heretik ilan edebilecek veya dini doktrinleri yasaklayıp izin verebilecek. Bu mekanik, otorite seviyesi düşük olsa bile Vatikan'ın Avrupa siyaseti üzerindeki ağırlığını hissettirmesini sağlayacak. By God Alone, hanedanınızı yönetirken artık sadece topraklara değil, ruhlara da hükmetmeniz gerektiğini hatırlatıyor.
