Refined Storage, ursprungligen släppt 2016, är en modifikation som fokuserar på att bygga och hantera ett nätverksbaserat lagringssystem. Spelare konstruerar komponenter som kontrollenheter och lagringsdiskar för att centralisera och effektivisera hanteringen av föremål och vätskor. Kärnan i spelet är att söka bland lagrade resurser, automatisera processer och prioritera lagring inom det expanderbara nätverket. Detta tilltalar spelare som uppskattar systematisering och logistik inom sin spelvärld.