Autumn Leaves, ursprungligen släppt 2015, är ett uppdragstillägg som kombinerar element från shooter- och rollspelsgenrerna. Spelaren utforskar Vault Hypatia, ett bibliotek bebott av kännande maskiner, för att lösa ett århundraden gammalt mysterium. Spelet utmärker sig med över 2000 röstade repliker, fem olika slut och ett unikt soundtrack, där dina val direkt påverkar berättelsens utgång.