MinecraftEdu, вышедший в 2011 году, представляет собой версию игры, ориентированную на образовательный процесс. Игроки занимаются совместным строительством и решением задач в блочном мире. Учителя могут настраивать параметры игры для проведения интерактивных симуляций по различным предметам. Основной режим — песочница с возможностью многопользовательской игры.