MinecraftEdu, wydany w 2011 roku, to edycja gry skupiona na zastosowaniach edukacyjnych. Gracze eksplorują i modyfikują świat zbudowany z bloków, współpracując przy projektach. Nauczyciele mogą dostosowywać ustawienia gry, by symulować różne scenariusze i wspierać naukę przedmiotów ścisłych i humanistycznych w kontrolowanym środowisku wirtualnym.