Deeper and Darker er en modifikasjon som utvider utforskning og overlevelse ved å introdusere en ny dimensjon kalt Otherside, med unike biomer som deeplands. Spillere får tilgang ved å beseire The Warden, og kan deretter benytte over hundre nye byggeblokker, nye gjenstander som warden-rustning, og møte åtte nye fiender, inkludert en miniboss. Modden, som ble utgitt i 2022, fokuserer på å legge til selvstendig innhold for spillere som søker dypere eventyr.