Honest Hearts Reborn, uitgebracht in 2015, is een verhaal-overhaul mod die de Shooter- en RPG-elementen uitbreidt. De gameplay richt zich op het herinterpreteren van het verhaal rond Joshua Graham en de Zion-stammen, waarbij spelers diepgaande morele keuzes maken. Kenmerkend zijn de volledig ingesproken dialogen en de introductie van nieuwe niet-speelbare personages, wat zorgt voor een frisse narratieve ervaring binnen de bestaande setting.