MinecraftEdu, izdan 2011. godine, predstavlja verziju igre usmjerenu na obrazovanje. Osnovna mehanika uključuje istraživanje i kreiranje svijeta baziranog na blokovima, gdje igrači surađuju na projektima i rješavaju probleme. Učitelji mogu prilagoditi postavke igre za simulacije u različitim predmetima, omogućujući strukturirano učenje u virtualnom okruženju za više igrača.