Uudistettu Defender of the Galaxy on jatkossa "Ambition", joka keskittyy galaktiseen yhteistyöhön. Se avaa uusia bonuksia nimenomaan Galactic Custodian -roolille, mutta sisältää merkittävän rajoituksen: se estää Galactic Imperiumin perustamisen. Tämä pakottaa pelaajat tekemään selkeän valinnan pyyteettömän suojelijan ja autoritäärisen hallitsijan välillä, mikä tuo lisää syvyyttä loppupelin poliittiseen vääntöön.
Uusi Heirs of the Khan -alkuperä (Origin) tarjoaa puolestaan kostoa janoaville pelaajille mielenkiintoisen polun. Se keskittyy entisten Marauder-klaanien väliseen välienselvittelyyn ja sisältää uniikkeja sotilassopimuksia. Pelaajilla on mahdollisuus nousta uudeksi Khaniksi ja yhdistää hajanaiset ryhmittymät rautaisen nyrkin alle.
Nomadi-elämäntapaa syvennetään Military Arkship -alusten myötä. Nämä massiiviset alukset on jaettu kolmeen tasoon (Tier), ja niiden varustelu vaikuttaa suoraan laivaston iskukykyyn. Arkshipeilla on käytössään erikoistoimintoja, kuten Strip Mine ja Reprocess Planet, jotka mahdollistavat resurssien keräämisen suoraan planeetoilta ilman kiinteitä siirtokuntia.
Sotiminen nomadina poikkeaa perinteisestä valloituksesta. Arkship-aluksia ei voi tuhota pommituksella, vaan ne on kohdattava suorassa avaruustaistelussa. Valloitusten myötä nomadit voivat luoda väliaikaisia "Purge-Vassal" -vasalleja, jotka auttavat hallitsemaan vallattuja alueita ilman tarvetta asettua aloilleen.
Lopuksi Champion's Forge Enclave esittelee kuusi uutta Paragon-johtajaa. Näistä mielenkiintoisin on legendaarinen Seralune, jolla on Amnesiac-ominaisuus ja oma tarinaketjunsa, joka avautuu pelin edetessä. Nämä muutokset tekevät Stellaris-universumista entistä elävämmän paikan niille, jotka suosivat liikkuvaa elämäntapaa galaksin laidalla.
