Applied Energistics on vuonna 2012 julkaistu lisäosa, joka keskittyy Minecraft-pelikokemuksen tehostamiseen kehittyneillä varastointi- ja automaatiojärjestelmillä. Pelaajan tehtävänä on rakentaa räätälöityjä ME-verkkoja esineiden tehokkaaseen hallintaan ja jakeluun. Peliin lisätään sähköisiä työkaluja ja koneita, jotka mahdollistavat monimutkaisten askartelu- ja resurssienjakotehtävien automatisoinnin, tarjoten syvällisen tavan hallita suuria tavaramääriä.
Tälle pelille ei ole saatavilla kuvakaappauksia.