Besonders kritisch war bisher ein Fehler auf Anra nach der Zwischensequenz mit Halyn, der das Spiel einfrieren lassen konnte. Dieser Hard-Lock gehört nun der Vergangenheit an, ebenso wie Probleme beim Zugriff auf den Vault. Wer sich in der Welt des Schiffes "Vessel" verfangen hat – etwa in der Arena der großen Fliege ohne den nötigen Haken – darf aufatmen: Die Entwickler haben gezielte Fixes implementiert, um solche Sackgassen zu verhindern.
Neben den technischen Reparaturen gibt es spürbare Quality-of-Life-Verbesserungen. Ein Highlight ist die automatische Freischaltung von Aufzügen, sobald man Halyn getroffen hat. Das spart unnötige Laufwege und sorgt für ein flüssigeres Erkundungserlebnis. Zudem wurden sogenannte "Unsafe Zones" hinzugefügt, um frustrierende Death-Loops zu unterbinden, in denen MIO direkt nach dem Respawn erneut sterben konnte.
Auch am Balancing wurde geschraubt. Der Gegenstand "Sharpened Hairpin" (Geschärfte Haarnadel) wurde in seiner perfekten Form angepasst, und negative Modifikatoren wurden neu kalibriert, um die Herausforderung fair zu halten. Kleinere Details runden das Paket ab: Die spanische Lokalisierung wurde korrigiert, Soundeffekte poliert und für das True Ending gibt es nun einen neuen holografischen Planeten zu bewundern.
Für PC-Spieler sind zudem spezifische Keyboard-Fixes für die Flowing Striders enthalten. Insgesamt macht Patch 2 den Trip durch die mechanische Arche deutlich runder und weniger fehleranfällig.
