Největší bombou je bezpochyby možnost hrát za samotného papeže nebo držitele církevních lén. Dosud byla teokracie v Crusader Kings III pro hráče tabu, ale to se mění. S tím souvisí i kompletní přepracování sboru kardinálů. Jako světský vládce budete moci skrze intriky a peníze ovlivňovat, kdo usedne na svatý stolec, přičemž kandidáti budou rozděleni na politické, zbožné nebo radikální typy.
Aktualizace přináší také systém „Duchovního naplnění“, což je v podstatě náboženský protipól ke stresu. Vaše činy v souladu s vírou vám otevřou nové možnosti, zatímco hříchy vás mohou dohnat k šílenství nebo exkomunikaci. Změny se dočká i mapa víry – nový systém „Rites“ umožní geografické rozdělení církve. To znamená, že vaše lokální interpretace křesťanství se může postupně odchýlit od Říma, což povede k heretickým hnutím nebo úplnému schizmatu.
Pro stratégy, kteří raději tahají za nitky z pozadí, přibude mechanika „Puppet“. Skrze svého dvorního kaplana budete moci nepřímo ovlivňovat církevní záležitosti a manipulovat s dogmaty ve svůj prospěch. Zajímavý detail se týká i startu v roce 867, kde bude křesťanství sjednoceno pod chalcedonskou vírou, ale bez jasné hlavy církve, což vytvoří prostor pro unikátní mocenský boj o prvenství.
